Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Casq1O09165 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Casq1O09165 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Casq1O09165 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Casq1O09165 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Casq1O09165 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Casq1O09165 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Casq1O09165 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms