Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms