Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20939L7N243 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms