Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ27

Ccdc191, Coiled-coil domain-containing 191, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc191J3QQ27 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc191J3QQ27 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc191J3QQ27 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms