Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21310J3QQ23 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21310J3QQ23 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21310J3QQ23 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21310J3QQ23 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21310J3QQ23 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21310J3QQ23 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21310J3QQ23 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21310J3QQ23 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21310J3QQ23 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21310J3QQ23 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21310J3QQ23 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21310J3QQ23 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21310J3QQ23 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21310J3QQ23 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21310J3QQ23 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21310J3QQ23 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21310J3QQ23 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21310J3QQ23 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21310J3QQ23 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21310J3QQ23 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21310J3QQ23 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21310J3QQ23 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21310J3QQ23 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21310J3QQ23 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21310J3QQ23 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21310J3QQ23 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21310J3QQ23 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21310J3QQ23 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21310J3QQ23 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21310J3QQ23 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21310J3QQ23 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms