Protein–RNA interactions for Protein: J3QNG1

Gm6408, Predicted gene 6408, mousemouse

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6408J3QNG1 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gm6408J3QNG1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gm6408J3QNG1 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gm6408J3QNG1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gm6408J3QNG1 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gm6408J3QNG1 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gm6408J3QNG1 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gm6408J3QNG1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gm6408J3QNG1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gm6408J3QNG1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gm6408J3QNG1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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