Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Gm21972J3QN38 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Gm21972J3QN38 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Gm21972J3QN38 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Gm21972J3QN38 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Gm21972J3QN38 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21972J3QN38 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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