Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm3336J3QMQ6 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms