Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK1

Sgo2b, Shugoshin 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2bJ3QMK1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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