Protein–RNA interactions for Protein: J3QME6

Lipo1, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo1J3QME6 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lipo1J3QME6 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lipo1J3QME6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lipo1J3QME6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lipo1J3QME6 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lipo1J3QME6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lipo1J3QME6 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lipo1J3QME6 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lipo1J3QME6 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lipo1J3QME6 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lipo1J3QME6 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lipo1J3QME6 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lipo1J3QME6 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lipo1J3QME6 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lipo1J3QME6 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lipo1J3QME6 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lipo1J3QME6 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lipo1J3QME6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lipo1J3QME6 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lipo1J3QME6 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lipo1J3QME6 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lipo1J3QME6 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lipo1J3QME6 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lipo1J3QME6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lipo1J3QME6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lipo1J3QME6 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lipo1J3QME6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lipo1J3QME6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lipo1J3QME6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lipo1J3QME6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lipo1J3QME6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms