Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c3J3QJW5 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms