Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
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Gm20830J3KML6 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Gm20830J3KML6 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Gm20830J3KML6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Gm20830J3KML6 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Gm20830J3KML6 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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