Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

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Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Taf4bG5E8Z2 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms