Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Cldn20G5E8X0 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn20G5E8X0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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