Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

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Length 688 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Sclt1G5E861 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Sclt1G5E861 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Sclt1G5E861 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms