Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms