Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Z7

Chrna9, Cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna9G3X8Z7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrna9G3X8Z7 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrna9G3X8Z7 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrna9G3X8Z7 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrna9G3X8Z7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrna9G3X8Z7 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrna9G3X8Z7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrna9G3X8Z7 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrna9G3X8Z7 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrna9G3X8Z7 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrna9G3X8Z7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrna9G3X8Z7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrna9G3X8Z7 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrna9G3X8Z7 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrna9G3X8Z7 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrna9G3X8Z7 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrna9G3X8Z7 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrna9G3X8Z7 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrna9G3X8Z7 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrna9G3X8Z7 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna9G3X8Z7 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna9G3X8Z7 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna9G3X8Z7 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna9G3X8Z7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna9G3X8Z7 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna9G3X8Z7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna9G3X8Z7 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna9G3X8Z7 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna9G3X8Z7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna9G3X8Z7 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna9G3X8Z7 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna9G3X8Z7 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna9G3X8Z7 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna9G3X8Z7 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna9G3X8Z7 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna9G3X8Z7 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna9G3X8Z7 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna9G3X8Z7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna9G3X8Z7 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna9G3X8Z7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna9G3X8Z7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrna9G3X8Z7 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms