Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms