Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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H2-M1F7CXU4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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H2-M1F7CXU4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
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H2-M1F7CXU4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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H2-M1F7CXU4 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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H2-M1F7CXU4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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H2-M1F7CXU4 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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H2-M1F7CXU4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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H2-M1F7CXU4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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H2-M1F7CXU4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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H2-M1F7CXU4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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H2-M1F7CXU4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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