Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms