Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms