Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms