Protein–RNA interactions for Protein: F6WY25

Gm10271, Predicted gene 10271, mousemouse

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Length 52 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10271F6WY25 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm10271F6WY25 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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