Protein–RNA interactions for Protein: F6QRE9

Erich3, Glutamate-rich 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erich3F6QRE9 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Erich3F6QRE9 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Erich3F6QRE9 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms