Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf4E9QAP7 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms