Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rdh16f1E9Q9P8 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rdh16f1E9Q9P8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rdh16f1E9Q9P8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rdh16f1E9Q9P8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Rdh16f1E9Q9P8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Rdh16f1E9Q9P8 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Rdh16f1E9Q9P8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Rdh16f1E9Q9P8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Rdh16f1E9Q9P8 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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