Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

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Length 693 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TrdnE9Q9K5 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TrdnE9Q9K5 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TrdnE9Q9K5 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TrdnE9Q9K5 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TrdnE9Q9K5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TrdnE9Q9K5 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TrdnE9Q9K5 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TrdnE9Q9K5 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TrdnE9Q9K5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TrdnE9Q9K5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TrdnE9Q9K5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TrdnE9Q9K5 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TrdnE9Q9K5 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TrdnE9Q9K5 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TrdnE9Q9K5 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TrdnE9Q9K5 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TrdnE9Q9K5 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TrdnE9Q9K5 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TrdnE9Q9K5 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TrdnE9Q9K5 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TrdnE9Q9K5 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TrdnE9Q9K5 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TrdnE9Q9K5 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TrdnE9Q9K5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TrdnE9Q9K5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TrdnE9Q9K5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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TrdnE9Q9K5 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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TrdnE9Q9K5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TrdnE9Q9K5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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TrdnE9Q9K5 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TrdnE9Q9K5 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TrdnE9Q9K5 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TrdnE9Q9K5 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TrdnE9Q9K5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TrdnE9Q9K5 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TrdnE9Q9K5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TrdnE9Q9K5 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TrdnE9Q9K5 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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TrdnE9Q9K5 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TrdnE9Q9K5 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TrdnE9Q9K5 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TrdnE9Q9K5 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TrdnE9Q9K5 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TrdnE9Q9K5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
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TrdnE9Q9K5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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TrdnE9Q9K5 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TrdnE9Q9K5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TrdnE9Q9K5 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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TrdnE9Q9K5 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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TrdnE9Q9K5 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TrdnE9Q9K5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TrdnE9Q9K5 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TrdnE9Q9K5 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TrdnE9Q9K5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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TrdnE9Q9K5 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TrdnE9Q9K5 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TrdnE9Q9K5 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TrdnE9Q9K5 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TrdnE9Q9K5 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TrdnE9Q9K5 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TrdnE9Q9K5 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TrdnE9Q9K5 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TrdnE9Q9K5 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TrdnE9Q9K5 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TrdnE9Q9K5 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
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TrdnE9Q9K5 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms