Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7F2

Rnf169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf169E9Q7F2 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms