Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms