Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
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ApobE9Q414 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
ApobE9Q414 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
ApobE9Q414 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
ApobE9Q414 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
ApobE9Q414 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
ApobE9Q414 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
ApobE9Q414 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
ApobE9Q414 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
ApobE9Q414 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
ApobE9Q414 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
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ApobE9Q414 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
ApobE9Q414 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
ApobE9Q414 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
ApobE9Q414 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
ApobE9Q414 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
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ApobE9Q414 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC8.83□□□□□ -1
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ApobE9Q414 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
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ApobE9Q414 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
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ApobE9Q414 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
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ApobE9Q414 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
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ApobE9Q414 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
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ApobE9Q414 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
ApobE9Q414 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC8.82□□□□□ -1
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ApobE9Q414 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
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ApobE9Q414 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC8.82□□□□□ -1
ApobE9Q414 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
ApobE9Q414 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
ApobE9Q414 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
ApobE9Q414 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
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