Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Susd1E9Q3H4 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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