Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zfp558E9Q1J0 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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