Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Myo5cE9Q1F5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Myo5cE9Q1F5 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Myo5cE9Q1F5 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Myo5cE9Q1F5 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Myo5cE9Q1F5 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Myo5cE9Q1F5 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Myo5cE9Q1F5 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Myo5cE9Q1F5 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Myo5cE9Q1F5 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Myo5cE9Q1F5 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Myo5cE9Q1F5 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Myo5cE9Q1F5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Myo5cE9Q1F5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Myo5cE9Q1F5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Myo5cE9Q1F5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Myo5cE9Q1F5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Myo5cE9Q1F5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Myo5cE9Q1F5 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Myo5cE9Q1F5 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Myo5cE9Q1F5 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Myo5cE9Q1F5 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Myo5cE9Q1F5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Myo5cE9Q1F5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Myo5cE9Q1F5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Myo5cE9Q1F5 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Myo5cE9Q1F5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Myo5cE9Q1F5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Myo5cE9Q1F5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Myo5cE9Q1F5 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Myo5cE9Q1F5 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Myo5cE9Q1F5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Myo5cE9Q1F5 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Myo5cE9Q1F5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Myo5cE9Q1F5 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Myo5cE9Q1F5 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms