Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms