Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Rps2-ps12-201ENSMUST00000214262 785 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms