Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms