Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms