Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ccdc144bE9PVZ3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms