Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms