Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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