Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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