Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms