Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clrn2B2RVW2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clrn2B2RVW2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clrn2B2RVW2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clrn2B2RVW2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clrn2B2RVW2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clrn2B2RVW2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clrn2B2RVW2 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clrn2B2RVW2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clrn2B2RVW2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clrn2B2RVW2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clrn2B2RVW2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clrn2B2RVW2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clrn2B2RVW2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clrn2B2RVW2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clrn2B2RVW2 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clrn2B2RVW2 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clrn2B2RVW2 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clrn2B2RVW2 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clrn2B2RVW2 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clrn2B2RVW2 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clrn2B2RVW2 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clrn2B2RVW2 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clrn2B2RVW2 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clrn2B2RVW2 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clrn2B2RVW2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clrn2B2RVW2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clrn2B2RVW2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clrn2B2RVW2 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clrn2B2RVW2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clrn2B2RVW2 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Clrn2B2RVW2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clrn2B2RVW2 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clrn2B2RVW2 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clrn2B2RVW2 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clrn2B2RVW2 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clrn2B2RVW2 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Clrn2B2RVW2 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Clrn2B2RVW2 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clrn2B2RVW2 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Clrn2B2RVW2 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clrn2B2RVW2 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Clrn2B2RVW2 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clrn2B2RVW2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clrn2B2RVW2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms