Protein–RNA interactions for Protein: B2RUR8

Otud7b, OTU domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud7bB2RUR8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud7bB2RUR8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud7bB2RUR8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud7bB2RUR8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud7bB2RUR8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud7bB2RUR8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud7bB2RUR8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud7bB2RUR8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud7bB2RUR8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud7bB2RUR8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud7bB2RUR8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud7bB2RUR8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud7bB2RUR8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud7bB2RUR8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud7bB2RUR8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud7bB2RUR8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud7bB2RUR8 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud7bB2RUR8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud7bB2RUR8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud7bB2RUR8 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud7bB2RUR8 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud7bB2RUR8 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud7bB2RUR8 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud7bB2RUR8 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud7bB2RUR8 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud7bB2RUR8 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud7bB2RUR8 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud7bB2RUR8 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud7bB2RUR8 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud7bB2RUR8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud7bB2RUR8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud7bB2RUR8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud7bB2RUR8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud7bB2RUR8 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud7bB2RUR8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud7bB2RUR8 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud7bB2RUR8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud7bB2RUR8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud7bB2RUR8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud7bB2RUR8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud7bB2RUR8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud7bB2RUR8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud7bB2RUR8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud7bB2RUR8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud7bB2RUR8 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud7bB2RUR8 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud7bB2RUR8 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud7bB2RUR8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud7bB2RUR8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud7bB2RUR8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud7bB2RUR8 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud7bB2RUR8 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud7bB2RUR8 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud7bB2RUR8 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud7bB2RUR8 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud7bB2RUR8 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud7bB2RUR8 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud7bB2RUR8 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud7bB2RUR8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud7bB2RUR8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud7bB2RUR8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud7bB2RUR8 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud7bB2RUR8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud7bB2RUR8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Otud7bB2RUR8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Otud7bB2RUR8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Otud7bB2RUR8 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud7bB2RUR8 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud7bB2RUR8 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud7bB2RUR8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud7bB2RUR8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud7bB2RUR8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud7bB2RUR8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud7bB2RUR8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud7bB2RUR8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud7bB2RUR8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud7bB2RUR8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud7bB2RUR8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud7bB2RUR8 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud7bB2RUR8 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud7bB2RUR8 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud7bB2RUR8 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud7bB2RUR8 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud7bB2RUR8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud7bB2RUR8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud7bB2RUR8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud7bB2RUR8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud7bB2RUR8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud7bB2RUR8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud7bB2RUR8 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud7bB2RUR8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud7bB2RUR8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud7bB2RUR8 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud7bB2RUR8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud7bB2RUR8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud7bB2RUR8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud7bB2RUR8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud7bB2RUR8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud7bB2RUR8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud7bB2RUR8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms