Protein–RNA interactions for Protein: B2RS76

Cpb1, Carboxypeptidase B1 (Tissue), isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpb1B2RS76 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpb1B2RS76 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpb1B2RS76 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpb1B2RS76 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpb1B2RS76 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpb1B2RS76 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpb1B2RS76 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpb1B2RS76 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpb1B2RS76 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpb1B2RS76 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpb1B2RS76 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpb1B2RS76 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpb1B2RS76 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpb1B2RS76 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpb1B2RS76 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpb1B2RS76 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpb1B2RS76 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpb1B2RS76 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpb1B2RS76 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpb1B2RS76 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpb1B2RS76 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpb1B2RS76 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpb1B2RS76 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpb1B2RS76 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpb1B2RS76 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpb1B2RS76 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpb1B2RS76 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpb1B2RS76 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpb1B2RS76 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpb1B2RS76 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpb1B2RS76 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms