Protein–RNA interactions for Protein: B2RRL2

Jrkl, Jerky protein homolog-like, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrklB2RRL2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
JrklB2RRL2 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
JrklB2RRL2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
JrklB2RRL2 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
JrklB2RRL2 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
JrklB2RRL2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
JrklB2RRL2 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
JrklB2RRL2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
JrklB2RRL2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
JrklB2RRL2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms