Protein–RNA interactions for Protein: B1AW18

4930402K13Rik, MCG54973, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930402K13RikB1AW18 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms