Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Trabd2bB1ATG9 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Trabd2bB1ATG9 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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