Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms