Protein–RNA interactions for Protein: B1ARV6

Pramef20, PRAME family member 20, mousemouse

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Length 477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef20B1ARV6 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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